Die Differenzierungslösung für die Karminfärbung nach Best in Ihrer Variante besteht aus einer Mischung von Ethanol und Methanol, die mit etwa 50 % Wasser verdünnt ist. Diese Lösung dient dazu, den überschüssigen Farbstoff selektiv aus bestimmten Gewebebestandteilen zu entfernen und so einen besseren Kontrast zwischen den gefärbten Strukturen zu erzielen.

Nach der Färbung mit der Karminlösung und der Gegenfärbung mit Hämatoxylin werden die Gewebeschnitte kurz in diese Differenzierungslösung getaucht oder über sie geschwenkt. Die alkoholische Lösung entfernt selektiv den überschüssigen Farbstoff aus den Gewebebestandteilen, wodurch der Hintergrund aufhellt und der Kontrast zwischen den gefärbten Strukturen verbessert wird. Die Differenzierungslösung ist ein wesentlicher Schritt in der Best's Karminfärbung, um scharfe und klare Bilder von Glykogen und anderen zellulären Strukturen in Gewebeschnitten zu erhalten.