Sudan III 0,2%, alkoholisch, ist ein wertvolles Diagnostikum für in vitro-Anwendungen. Seine Hauptverwendung findet in der Histologie, wo es als lipophiler Farbstoff zur Färbung und Identifizierung von Fett und lipiden Strukturen eingesetzt wird. Dabei ist seine Bindungsfähigkeit an solche Strukturen aufgrund seiner lipophilen Eigenschaften und der hydrophoben Wechselwirkungen zurückzuführen.

Auf chemischer Ebene löst sich Sudan III in den verwendeten Alkoholen Ethanol und 1-Propanol und bindet anschließend an lipide Strukturen in der Gewebeprobe. Die resultierende Färbung erlaubt eine visuelle Differenzierung und Identifikation dieser Strukturen unter dem Mikroskop.

Anwendungsergebnisse variieren je nach Probenart und -zustand. Sie können jedoch dazu beitragen, die Verteilung von Fettgewebe oder anderen lipiden Strukturen in einer Probe zu ermitteln, was bei bestimmten Krankheitsbildern wie Adipositas oder Arteriosklerose von Bedeutung sein kann.