Methylenblau, chemisch als Methylthioniniumchlorid bezeichnet, ist ein heterozyklisches aromatisches Molekül, das eine Reihe chemischer und physikalischer Eigenschaften aufweist, die seine Anwendung als Färbemittel ermöglichen.

Einer der wichtigsten Aspekte von Methylenblau ist seine Fähigkeit zur Farbgebung, die auf seiner Struktur als Phenothiazin-Derivat basiert. Diese Struktur ermöglicht eine umfangreiche Konjugation von π-Elektronen, die zu der intensiven blauen Farbe des Moleküls führt.

Chemisch gesehen hat Methylenblau die Fähigkeit, in Redox-Reaktionen zu agieren. Es kann zwischen einer reduzierten, farblosen Form und einer oxidierten, blauen Form wechseln. Dies ist besonders nützlich in biologischen Systemen, da es auf diese Weise Veränderungen im Redox-Status einer Zelle oder eines Gewebes anzeigen kann.

Darüber hinaus hat Methylenblau eine hohe Affinität zu bestimmten biologischen Molekülen, insbesondere zu Nukleinsäuren. Durch die Wechselwirkung mit den Phosphatgruppen der Nukleinsäuren ermöglicht es eine selektive Färbung von Zellen und Geweben.